百泉始凿于殷商，经历代修建，成为河南省最古老、保存最完整的古园林建筑群。山水相依，风景秀美，素有“中州颐和园，北国小西湖”之称。百泉北牵群山，南吐清泉，百眼跳珠，汇泉成川，缓缓南流，遂成卫河之源，古人把自然的恩赐归于神佑，隋大业年间（公元605年）修庙一座，敬祀神灵。到明洪武八年，百泉药交会得到官方支持，逐渐成型。
   
    庙成始祭，人多成会，定于四月初八，时太行山及山西一带，盛产药材，有“中药宝库”之誉。百泉地处中原，位于交通要塞，“东接齐鲁，西控三晋”，庙会便成了药材互货的场所。“明洪武八年，御祭於四月朔八日，令起大会。”从此得官方支持，百泉药交会正式兴起，1718年，药商捐币在苏门山下修建了药王庙，供奉药王三真人，即神农氏、长桑君、孙思邈，大会规模更甚，据药志记，历史上国内同南禹北祁齐名，国外同英国的威斯他州、斯探索立奇类同。
   
    清道光《辉县志》载“四月八日，祭卫源神庙，四方贸易者皆列，南北药材，聚十余日始散。”每当细柳摇青季节，从长白山麓到珠江河畔，从天山脚下到东海之滨，各路药商，不远千里，云集百泉。互货客商与趁会游览者络绎不绝。湖畔两岸，人如潮涌，其商品之屯集，游人之攒动，市房之栉比，帐幕之鳞接，飘摇之市招，喧闹之市声，热闹非凡。国内药界一位资深人士感慨地说：从古到今，百泉药都为人类健康和社会发展作出了不可估量的贡献。
   
     新中国建立后，百泉药交会受到党和政府的高度重视。国家中医药管理局、国家计委、卫生部、商业部、国家工商局、物价局等六部委，将百泉药交会确定为全国三大药交会和十大药市之一。国家、省、市有关部门和领导多次视察百泉药交会。时任河南省委书记的中央政治局常委李长春，多次对百泉药交会进行批示，指出：“要把百泉药材市场办成全国最具吸引力的市场”，并视察了1991年百泉药交会。2008年，百泉药交会被国务院列入国家级非物质文化遗产目录，她是一种不可替代的文化传承。
   
    据1931年统计，参加百泉药材大会的有河南、河北、山东、山西、北京、安徽6省市42县623家铺户，经营有南货，即四川、云南、贵州、湖广等地所产药材；山货，即河南、山西、太行山区所产的药材；以及怀庆府所产的地黄、牛膝、菊花、山药“四大怀药”等，计约200余种。风景秀丽的百泉，更引来各地人士趁大会期间来此旅游，会期人数最多时竟达10万之众，故而形成“春暖花开到百泉，不到百泉药不全”之说。