樊姓的起源主要有二：

    一是出自姬姓，其始祖为周王的后人仲山甫，也有书上称他为仲山父。仲山甫是辅佐周宣王中兴的大臣，深受周王的器重。当时宣王的大臣尹吉甫曾作诗《民》来赞颂仲山甫的功绩，这首诗收录在《诗经》中。周宣王赐他封地于樊，所以他又被称为樊仲、樊穆仲。樊，也叫阳樊，在今河南省济源市西南，是樊姓的祖根所在。仲山甫的后裔遂以封地作为自己姓氏。周朝后期由于樊国为晋所灭，仲山甫的后裔子孙流落各地。自战国至西汉，樊姓有一支迁居到南阳唐河县湖阳一带，迅速繁衍成为南阳地区大姓。西汉末年，湖阳樊姓到樊重这一代成为当地有名的豪族。樊重是东汉光武帝刘秀的外祖父。东汉建立后，刘秀先后封樊宏、樊丹、樊寻、樊忠、樊茂五人为侯，并追封樊重为寿张敬侯。樊宏的长子樊精通儒学，授徒三千，时人称为樊侯学。到汉明帝永平年间，湖阳樊姓与外戚郭、阴、马姓掌握了东汉朝政大权，并称为“四大姓”。西晋永嘉年间湖阳樊姓宗族为避战乱南迁于淮南一带。湖阳樊姓樊宏的后人樊僧远，则举家迁于今江西庐江定居，为庐江樊姓的始迁祖。到隋唐的时候，湖阳樊姓樊宏的后人樊咏迁居到河中府河东县(今山西永济)。

    另有湖阳樊姓后人樊思贤迁居于湖北江陵，为江陵樊姓始迁祖。宋元时期，樊姓子孙为避战乱，很多人由北方迁到浙江、江苏、安徽等地居住。到明清两代樊姓子孙或躲战乱，或旅居异乡，或做官外任而散播到南北各地，成为我国分布比较广泛的姓氏。