商丘属淮河流域，分属洪泽湖、涡河、南四湖三大水系。境内流域面积在1000平方公里以上的骨干河流有涡河、惠济河、沱河、黄河故道、浍河、大沙河等。河流大多呈西北东南流向，大致平行相间分布，多属季节性雨源型。全市多年平均天然水资源总量22.84亿立方米，平均每平方公里21.34万立方米，人均水资源267.13立方米。